تُنَظّم الجائزة تحت رعاية مدير جامعة الشارقة، ويُكلَّف عميد كلية الشريعة برئاسة هيئة الجائزة، وتشكّل الهيئة من محكمين وخبراء متخصّصين في محور الجائزة  المحَّدد كل سنة، وقد يستعان بخبراء من جامعات أخرى، شريطة أن يكون  الخبير من رتبة أستاذ، ويكون تخصّصه مطابقاً لمحور الجائزة.

وتُناط بهيئة الجائزة  المهام الآتية:

1. اختيار محور الجائزة كل سنة.

2. تحكيم البحوث المرشَّحة إذا كان العضو متخصِّصاً في موضوع المحور المقتَرح.

3. اقتراح خبراء خارجيين للتّحكيم.

4. النّظر في تقارير المحكّمين، واختيار الفائز.